Die Produktion von Alpina-Modellen auf Basis des E36 begann 1991 mit der Markteinführung des Alpina B6 2.8/2, der mit einem überarbeiteten, vom M50 abgeleiteten Motor ausgestattet war.
Ein exklusiv für den japanischen Markt entwickelter B6 2.8/2 Kombi wurde zwischen 1996 und 1998 produziert.
1993 wurde der 2.8/2 durch den B6 3.0 ersetzt, nachdem der 3-Liter-S50-Motor eingeführt worden war, der in den neuen M3-Modellen zum Einsatz kam. Alpina-Modelle wurden nun auch als Cabriolet und Touring angeboten, nicht mehr nur als Coupé und Limousine. 1996 präsentierte Alpina den B3 3.2, nachdem der S50-Motor auf 3,2 Liter Hubraum vergrößert worden war. Mit den neuen 3.2-Modellen basierten die Alpinas nun auf dem 328i mit seinem 2,8-Liter-Motor anstatt auf den 325i-Modellen.
Alle Alpina-Modelle waren mit den charakteristischen 20-Speichen-Felgen von Alpina sowie optionalen Zierstreifen ausgestattet. Zudem verfügten die Alpina-Modelle über spezielle Aerodynamik-Komponenten, darunter eine Alpina-Frontlippe und einen Heckspoiler. Auch der Innenraum wurde überarbeitet und umfasste neue blaue Instrumententafeln, Holzapplikationen, neue Sitze und ein neues Lenkrad.